穿透角膜移植术是以全层透明角膜代替全层病变角膜的方法。适应症按其手术目的可分为光学性、治疗性、成形性、美容性等方面。

光学性角膜移植术常见的适应症为圆锥角膜、各种原因所致的角膜瘢痕、各种角膜营养不良、各种原因的所致的角膜内皮细胞功能衰竭、各种角膜变性。

治疗性角膜移植术的适应症为感染性角膜溃疡、眼化学伤、蚕蚀性角膜溃疡、角膜边缘变性等所致的角膜溶解、变薄或穿孔。

板层角膜移植术是一种部分厚度的角膜移植。只切除有病变的角膜中浅层组织，深层比较完好的受主角膜仍然保留作为移植床，然后取同样大小和厚度的供体角膜前层角膜片，缝于受体角膜的创面上。

板层角膜移植不穿透前房，属于眼外手术，一般不扰动眼内组织，并发症较少，且排斥几率更低。故凡角膜病变未侵犯角膜深层，且内皮生理功能正常者，均可行板层角膜移植术。临床常用于中浅层角膜混浊、角膜营养不良性混浊、圆锥角膜、角膜中浅层感染、角膜肿瘤等。

角膜内皮移植术是指仅移植供体包括角膜内皮层的角膜内层部份组织。该术式适用于角膜内皮细胞功能衰竭而基质层无明显疤痕的患者。

角膜内皮移植术是近10余年来发展起来的一种新的角膜移植手术方式，相对于传统的穿透性角膜移植，角膜内皮移植大大降低了术后的排斥几率，且手术只需要通过一个类似于白内障手术的微小切口就能完成同时不需要在角膜上缝线，因此该术式具有更高的安全性及术后可获得更快的视力恢复。